La digitalización de tejidos
De la microscopía clásica a la visualización
Resumen
La microscopía ha tenido un rápido desarrollo tecnológico que ha cambiado la forma de ver al mundo y ha permitido la visualización de objetos y organismos microscópicos, así como una mejor interpretación de la relación de las células dentro de un tejido. Visium es una tecnología de análisis espacial desarrollada por la empresa 10x Genomics. Visium utiliza la histología, microscopía, captura de imágenes de alta resolución y secuenciación para generar un mapa de expresión génica en un tejido de interés. Esta suma de herramientas ha permitido incrementar el conocimiento sobre la aparición y progresión de diversas enfermedades.
Citas
Croft WJ. (2006) Under the Microscope: A Brief History of Microscopy: World Scientific; p. 5-14.
Sánchez Lera RM, Oliva García NR. (2015) Historia del microscopio y su repercusión en la Microbiología. Humanidades Médicas. 15:355-72.
Stahl PL, Salmen F, Vickovic S, Lundmark A, Navarro JF, Magnusson J, et al. (2016) Visualization and analysis of gene expression in tissue sections by spatial transcriptomics. Science. 353(6294):78-82. https://doi.org/10.1126/science.aaf2403.
Cable DM, Murray E, Zou LS, Goeva A, Macosko EZ, Chen F, et al. (2022) Robust decomposition of cell type mixtures in spatial transcriptomics. Nat Biotechnol. 40(4):517-26. https://doi.org/10.1038/s41587-021-00830-w.
Genomics X. (2023) Novel insights about your tissue, visualized. [Disponible en: https://www.10xgenomics.com/spatial-transcriptomics.
Sadi AM, Wang DY, Youngson BJ, Miller N, Boerner S, Done SJ, et al. (2011) Clinical relevance of DNA microarray analyses using archival formalin-fixed paraffin-embedded breast cancer specimens. BMC Cancer. 11:253:1-13. https://doi.org/10.1186/1471-2407-11-253.
Garcia-Alonso L, Handfield LF, Roberts K, Nikolakopoulou K, Fernando RC, Gardner L, et al. (2023) Author Correction: Mapping the temporal and spatial dynamics of the human endometrium in vivo and in vitro. Nat Genet. 55(1):165. https://doi.org/10.1038/s41588-021-00972-2.
Danan CH, Katada K, Parham LR, Hamilton KE. (2023) Spatial transcriptomics add a new dimension to our understanding of the gut. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 324(2):G91-G8. https://doi.org/10.1152/ajpgi.00191.2022.
Janesick A, Shelansky R, Gottscho AD, Wagner F, Rouault M, Beliakoff G, et al. (2022) High resolution mapping of the breast cancer tumor microenvironment using integrated single cell, spatial and in situ analysis of FFPE tissue. bioRxiv. 2022.10.06.510405. https://doi.org/10.1101/2022.10.06.510405.
Chen WT, Lu A, Craessaerts K, Pavie B, Sala Frigerio C, Corthout N, et al. (2020) Spatial Transcriptomics and In Situ Sequencing to Study Alzheimer’s Disease. Cell. 182(4):976-91 e19. https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.06.038.

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