ATAC-seq, the key to unlock the genome secrets

Authors

Keywords:

Chromatin, Transposase, Massive-sequencing, DNA-compaction, Bioinformatics

Abstract

The genome of each cell is huge and highly compacted within the nucleus as chromatin. However, not all DNA-encoded information is required simultaneously; only a subset of genes is activated depending on the cell type and specific conditions. Chromatin contains inaccessible regions due to its high compaction level, while accessible areas correspond to functionally active genes. ATAC-seq is a powerful technique for accurately identifying accessible regions of the genome, offering critical insights into gene regulation and chromatin organization.



Author Biographies

Víctor Julián Valdés, Instituto de Fisiología Celular, UNAM, CDMX, México.

Es investigador titular del Laboratorio de Epigenética y Medio Ambiente, en el Instituto de Fisiología Celular, UNAM. Estudió la licenciatura de Investigación Biomédica Básica y el doctorado en Ciencias Biomédicas. Desde 2018 su grupo estudia cómo el ambiente altera la estructura del ADN dentro del núcleo celular y la relación de estos cambios con distintas patologías. En su laboratorio se emplean técnicas de biología molecular y celular de vanguardia.



Jaqueline Hersch-González, Instituto de Fisiología Celular, UNAM, CDMX, México.

Es bióloga egresada de la Facultad de Ciencias, UNAM. Realizó sus estudios de Maestría en Ciencias Bioquímicas estudiando genes duplicados de la levadura. Actualmente está finalizando sus estudios de Doctorado en Ciencias Bioquímicas en el Laboratorio de Epigenética y Medio Ambiente, IFC UNAM. Tiene experiencia en técnicas de microbiología, biología molecular y análisis de datos, principalmente. Le interesan temas de evolución de microorganismos, microbioma y epigenética.

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Published

2025-05-14

How to Cite

Valdés, V. J., & Hersch-González, J. (2025). ATAC-seq, the key to unlock the genome secrets. Revista De divulgación científica IBIO, 7(2), 229. Retrieved from http://revistaibio.com/ojs33/index.php/main/article/view/229